宁古塔副都统是清朝在今黑龙江省宁安设立的正二品副都统官职。隶属于宁古塔将军(康熙十五年1676年移防为吉林将军)。
顺治十年(1653年)设立。为黑龙江流域最早设立的副都统。驻宁古塔(今海林县境)。康熙五年(1666年)移驻今宁安县城。
宣统元年裁撤。[1]