Dicer

Dicer,人體內由DICER1基因編碼,是一種在RNA干擾中扮演着重要角色的RNA酶,屬於III型RNA酶(RNase III)。在RNA誘導沉默複合體(RISC)的激活中,Dicer扮演着核心角色。在RNA干擾過程中,Dicer可以將shRNA(小髮卡RNA)切割、加工爲siRNA(小干擾RNA),將miRNA前體加工爲miRNA(微RNA)。

Dicer 1, ribonuclease III
識別號
别名;DICER1、Dicer1, Dcr-1 homolog、Dicer酶、dicer 1, double-stranded RNA-specific endoribonuclease、dicer 1, ribonuclease type III、endoribonuclease Dicer、helicase MOI、helicase with RNAse motif
外部IDGeneCards
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

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Ensembl

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UniProt

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mRNA序列

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蛋白序列

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基因位置(UCSC)n/an/a
PubMed查找n/an/a
維基數據
檢視/編輯 人類

功能

Dicer酶的作用是將shRNA剪切爲siRNA或將miRNA前體剪切爲miRNA

Dicer酶會將轉錄而成的、經Drosha酶初步處理的shRNA(小髮卡RNA)剪切爲,或將miRNA前體(pre-miRNA)剪切爲miRNA。隨後,siRNA或miRNA會激活RISC的組裝和功能的行駛,使RNA干擾得以繼續進行[1]


結構

肠贾第鞭毛虫(Giardia intestinalis)體內的Dicer蛋白。III型RNA酶結構域以綠色標出,PAZ以黃色標出,平臺結構域以紅色標出,連接不同結構域的螺旋以藍色標出[2]

人DICER蛋白屬於III型RNA酶,因爲DICER有解旋酶活性以及PAZ結構域(Piwi/Argonaute/Zwille)[3][4]。除了上述結構域外,DICER蛋白還有兩個RNaseIII結構域和兩個雙鏈RNA結合結構域(DUF283和dsRBD)[5]

目前的研究表明PAZ結構域可以和shRNA(小髮卡RNA)3'端兩個凸出的核苷酸結合,III型RNA酶結構域則會在dsRNA周圍形成一個假二聚體,啓動核酸鏈的剪切,使shRNA長度逐漸縮短。PAZ結構域和III型RNA酶結構域之間的距離由連接他們的螺旋結構決定,會影響到產生的miRNA/siRNA長度[2]。Dicer的dsRBD結構域會與shRNA結合,不過目前並未解析出具體的結合位點。推測認爲dsRBD區可能會與一些調節蛋白(比如人體內的TRBP,果蠅體內的R2D2、Loqs)結合形成複合體,調控RNA酶活性,進而調節終產物的產生[6]。有推測認爲解旋酶結構域會參與對長底物的處理[6]

參見


參考

  1. Bernstein E, Caudy A, Hammond S, Hannon G. . Nature. 2001, 409 (6818): 363–6. PMID 11201747. doi:10.1038/35053110.
  2. Macrae IJ, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks AN, Cande WZ, Adams PD, Doudna JA. . Science. Jan 2006, 311 (5758): 195–8. PMID 16410517. doi:10.1126/science.1121638.
  3. . (原始内容存档于2019-09-24).
  4. Matsuda S, Ichigotani Y, Okuda T, Irimura T, Nakatsugawa S, Hamaguchi M. . Biochimica et Biophysica Acta. Jan 2000, 1490 (1-2): 163–9. PMID 10786632. doi:10.1016/S0167-4781(99)00221-3.
  5. Hammond SM. . FEBS Letters. Oct 2005, 579 (26): 5822–9. PMID 16214139. doi:10.1016/j.febslet.2005.08.079.
  6. Cenik ES, Fukunaga R, Lu G, Dutcher R, Wang Y, Tanaka Hall TM, Zamore PD. . Molecular Cell. Apr 2011, 42 (2): 172–84. PMC 3115569. PMID 21419681. doi:10.1016/j.molcel.2011.03.002.
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