Rf1病毒
蝙蝠冠狀病毒Rf1（Bat SARS CoV Rf1/2004）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，為SARS-CoV相關病毒，在中國湖北的馬鐵菊頭蝠樣本中發現，於2005年發表。
| Rf1病毒 | |
|---|---|
病毒分類  | |
| –未分级–： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 網巢病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
| 亚属： | 沙贝病毒亚属 Sarbecovirus |
| 种： | SARSr-CoV |
| 病毒株： | Rf1病毒 Rf1 |
發現
2004年3月至11月，研究人員在中國廣東、天津、廣西與湖北四省市採集蝙蝠樣本，在湖北宜昌馬鐵菊頭蝠的糞便樣本中發現SARS相關病毒，即Rf1病毒，於2005年和Rp3病毒與Rm1病毒一起被發表[1]。
基因組
Rf1病毒的基因組長29709nt[2]，序列與SARS-CoV的相似度為87.8%[3]，其ORF8和人類以外的大多數SARSr-CoV一樣有一段長29nt的插入序列，為一完整的開放閱讀框，人類的ORF8則因缺少此序列而被分成8a與8b兩個較小的開放閱讀框。Rf1與人類SARS病毒ORF8輔助蛋白大小完全相同（由122個胺基酸組成），兩者胺基酸序列相似度為80%，相較之下Rp3與Rm1和SARS-CoV的ORF8胺基酸序列相似度僅有35%，但在刺突蛋白的S1區域，Rf1與Rp3及Rm1的關係比與SARS-CoV的關係接近，顯示這些病毒曾有基因重組發生[1]。另外Rf1與許多蝙蝠SARSr-CoV一樣在刺突蛋白的受體結合結構域（receptor binding domain, RBD）有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失（但不見於WIV1病毒與SHC014病毒）[4]。
參考文獻
- Li, W. . Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391.
- . NCBI.
- Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa; Shi, Zheng-Li; Perlman, S. . Journal of Virology. 2016, 90 (6): 3253–3256. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02582-15.
- Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; 等. . Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15.
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